После завершения синтеза часто остаются ненужные реактивы или отходы. Их нельзя просто выливать в раковину или выбрасывать в мусор. Некоторые вещества токсичны или могут вызвать реакцию с бытовой химией. Лучше всего собирать остатки в отдельные ёмкости и сдавать в специальные пункты утилизации. Если такой возможности нет, хотя бы нейтрализовать опасные компоненты с помощью соды или кислоты, чтобы снизить вред.