На каждом этапе синтеза психоактивных веществ образуются промежуточные продукты и побочные соединения. Для их удаления используют методы фильтрации, перекристаллизации и экстракции. Определение чистоты промежуточных продуктов проводят с помощью тонкослойной или газовой хроматографии. Очистка каждого этапа важна для повышения выхода и качества конечного продукта. Особое внимание уделяется удалению токсичных примесей, которые могут негативно повлиять на свойства вещества. Использование высокочистых реагентов и лабораторной посуды минимизирует количество побочных соединений.
