Нелегальні лабораторії та самовільні плантації можуть стати джерелом значного екологічного забруднення. Відходи та промивні розчини, залишки субстратів, пестицидів та інших речовин потрапляють у ґрунт і підземні води, змінюючи їх хімічний склад і біологічні властивості. Це може призводити до накопичення токсичних елементів у рослинах та водних екосистемах, а також до втрати ґрунтової родючості. Ланцюг екологічних наслідків охоплює зниження біорізноманіття, загибель корисної мікрофлори та фауни, а також ризики для громадського здоров’я через питну воду та продовольчі ланцюги. Усвідомлення цих ризиків важливе для формування стратегій реагування після виявлення незаконних об’єктів: комплексна оцінка забруднення, моніторинг, реставраційні заходи та інформування місцевих громад. Підхід має бути міждисциплінарним, з залученням екологів, токсикологів та фахівців з охорони здоров’я.