Помимо самих нейронов, в мозге есть глиальные клетки, в том числе олигодендроциты, которые создают миелиновую оболочку ('изоляцию') вокруг аксонов. Исследования на животных показывают, что метамфетамин вызывает апоптоз ('самоубийство') этих клеток. Потеря 'изоляции' приводит к замедлению и нарушению передачи нервных импульсов. Это является одним из механизмов долгосрочных когнитивных нарушений ('соображалка не работает') и может лежать в основе развития полинейропатии.