Серотонин играет ключевую роль в регуляции циклов сна. Хроническое употребление MDMA, нарушающее работу серотониновой системы, может приводить к долгосрочным проблемам со сном. Даже после прекращения употребления многие бывшие пользователи жалуются на трудности с засыпанием, поверхностный, прерывистый сон и отсутствие ощущения отдыха по утрам. Считается, что это связано с повреждением серотониновых нейронов, которые отходят от ядер шва в стволе мозга и отвечают за индукцию и поддержание глубоких фаз сна.