Вредители могут стать серьезной проблемой для гроверов. Для контроля вредителей в гроубоксе применяются различные методы. Профилактика включает поддержание чистоты, использование стерильного субстрата, установку барьеров (например, мелкой сетки на входе вентиляции) и регулярный осмотр растений. При обнаружении вредителей можно использовать биологические методы (хищные насекомые), органические инсектициды (масло ним, инсектицидное мыло) или химические препараты в крайних случаях. Важно правильно идентифицировать вредителя (паутинный клещ, тля, белокрылка) для выбора наиболее эффективного метода борьбы. Ротация методов предотвращает выработку резистентности у вредителей.