Хотя микродозинг чаще ассоциируется с LSD и псилоцибином, некоторые энтузиасты экспериментируют и с мескалином (обычно из кактуса Сан-Педро). Субъективно, пользователи описывают его эффект как более 'теплый', 'сердечный' и ориентированный на эмпатию и социальное взаимодействие, в отличие от более 'церебрального' и аналитического эффекта от микродоз LSD. Он может быть полезен для борьбы с социальной тревогой. Однако, из-за долгого действия мескалина, эффект от микродозы может длиться весь день, что не всегда удобно.