Одним из ключевых механизмов психотерапии с помощью MDMA при лечении Посттравматического стрессового расстройства (ПТСР) является 'перепрошивка' травматической памяти. MDMA снижает активность амигдалы (центра страха) и усиливает работу префронтальной коры (центра контроля). Это позволяет пациенту вспомнить травматическое событие, но не быть захлестнутым ужасом и паникой. В этом 'окне безопасности' он может под руководством терапевта переосмыслить событие, интегрировать его в свою биографию и сформировать новые, менее болезненные ассоциативные связи. Таким образом, сама память не стирается, но ее эмоциональный 'заряд' меняется с ужасающего на нейтральный.